পশ্চিমবঙ্গে প্রথম দফায় ২৫২টি ঐতিহ্যবাহী খারেজী মাদরাসা বন্ধের সরকারি নির্দেশ এবং ১০০টি মাদরাসা শোকজের ঘটনা রাজ্যজুড়ে তীব্র বিতর্কের ঝড় তুলেছে। বিশেষ করে মালদহ, মুর্শিদাবাদ ও উত্তর দিনাজপুরের মতো সংখ্যালঘু প্রধান জেলাগুলোতে গণঅসন্তোষ চরম আকার ধারণ করেছে। শত শত বছর ধরে এই খারেজী মাদরাসাগুলো সম্পূর্ণ স্বাবলম্বীভাবে দরিদ্র ও সুবিধাবঞ্চিত মুসলিম শিশুদের বিনামূল্যে ইসলামের প্রকৃত শিক্ষা ও নৈতিক আদর্শ প্রদান করে আসছে। ‘মাদরাসা বাঁচাও কমিটি’ ও ‘অল ইন্ডিয়া মাইনরিটি ফোরাম’-এর মতো শীর্ষস্থানীয় সংগঠনগুলোর অভিযোগ, আধুনিকীকরণের খোঁড়া অজুহাতে এই ধর্মীয় প্রতিষ্ঠানগুলোকে স্তব্ধ করা আসলে মুসলিম সমাজের মেরুদণ্ড ভেঙে দেওয়ার এবং তাদের নিজস্ব সংস্কৃতি থেকে দূরে রাখার এক সুগভীর ব্লুপ্রিন্ট। তৃণমূল ও বামপন্থি দলগুলোর একাংশও একে ধর্মীয় স্বাধীনতার ওপর আঘাত বলে তীব্র ক্ষোভ প্রকাশ করেছে।
